More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0133 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0133  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 494 aa  1019    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 662 aa  251  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 490 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  34.16 
 
 		 518 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 532 aa  226  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 520 aa  226  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 585 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 582 aa  226  7e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.35 
 
 		 561 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.95 
 
 		 561 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 563 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 563 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 563 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 582 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 563 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.36 
 
 		 561 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.29 
 
 		 561 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.75 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 		 495 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 506 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.95 
 
 		 561 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 584 aa  219  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 		 521 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 508 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 544 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.66 
 
 		 512 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 498 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1530  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 518 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 511 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 		 557 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 		 519 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 487 aa  210  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.28 
 
 		 491 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  30.8 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  29.33 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 		 525 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 550 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.78 
 
 		 503 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1886  pseudouridine synthase, Rsu  30.49 
 
 		 533 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 561 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 		 512 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4840  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 522 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 		 521 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 559 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  28.6 
 
 		 518 aa  205  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 566 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 499 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.79 
 
 		 585 aa  204  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  28.57 
 
 		 508 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  30.8 
 
 		 496 aa  203  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0667  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 536 aa  203  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 543 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.65 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.51 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.31 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.51 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 573 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.65 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.65 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 520 aa  201  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.65 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.65 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.65 
 
 		 510 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  29.11 
 
 		 511 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 		 527 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 500 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0799  hypothetical protein  28.4 
 
 		 564 aa  199  9e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.39313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.42 
 
 		 524 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.46 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  28.31 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  30.59 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  30.59 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  28.43 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2155  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 594 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  27.35 
 
 		 503 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  29.75 
 
 		 496 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 		 577 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  30.11 
 
 		 509 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 543 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  30.13 
 
 		 504 aa  196  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.85 
 
 		 513 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 		 562 aa  196  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 		 562 aa  196  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  28.51 
 
 		 510 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  27.58 
 
 		 503 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.59 
 
 		 492 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 516 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  30.8 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 		 588 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.72 
 
 		 516 aa  194  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  29.24 
 
 		 503 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>