More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1232 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  58.56 
 
 		 226 aa  261  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  56.95 
 
 		 224 aa  255  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  56.95 
 
 		 224 aa  254  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  58.74 
 
 		 222 aa  251  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  58.56 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  56.89 
 
 		 222 aa  244  9e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2060  hypothetical protein  55.86 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04561  TIM-barrel fold family protein  42.53 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.618562  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21481  TIM-barrel fold family protein  46.92 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0390  hypothetical protein  40.09 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.250945  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04461  TIM-barrel fold family protein  39.07 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04141  TIM-barrel fold family protein  39.35 
 
 		 211 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1729  hypothetical protein  38.6 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 231 aa  158  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  43.87 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  44.6 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2025  hypothetical protein  41.44 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0989114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  41.99 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03911  TIM-barrel fold family protein  41.26 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04451  TIM-barrel fold family protein  40.59 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.344267  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0647  hypothetical protein  42.65 
 
 		 199 aa  152  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.824567  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  42.72 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4812  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 232 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  36.2 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  41.15 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2108  hypothetical protein  36.2 
 
 		 219 aa  148  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000109011  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  42.11 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  42.11 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  42.11 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  42.58 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  42.25 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  41.63 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  41.01 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.86 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  39.91 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  39.29 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  38.86 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  41.31 
 
 		 241 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  40.77 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  41.78 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  41.51 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  41.94 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  41.71 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  39.71 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  41.04 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  40.28 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  42.06 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  39.56 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0440  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.475381  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0263  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.5 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.456825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  33.99 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  41.15 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.34 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  41.04 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  41.31 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  41.78 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  44.13 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  40.74 
 
 		 238 aa  138  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  40.48 
 
 		 231 aa  138  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.67 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  36.61 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  39.63 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  38.86 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  38.86 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  38.86 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  40.38 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  39.72 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.86 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.91 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  38.86 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  38.86 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  43.06 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  38.33 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  38.86 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  38.86 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  38.86 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  39.23 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  37.74 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  40.57 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  40.38 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  39.46 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  39.56 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  37.56 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  39.44 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  38.35 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0647  alanine racemase domain-containing protein  40.76 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  41.23 
 
 		 268 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2216  hypothetical protein  35.34 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000309161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  40.67 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  40.1 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  37.38 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  40.95 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  40.95 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2190  hypothetical cytosolic protein  35.34 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.724398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  39.01 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>