More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0002 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.76 
 
 
280 aa  308  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.78 
 
 
292 aa  213  3e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  41.03 
 
 
295 aa  212  5e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
295 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  46.12 
 
 
665 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 
661 aa  197  2e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 
671 aa  188  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  42.17 
 
 
659 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 
665 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  41.87 
 
 
319 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
664 aa  184  1e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
668 aa  183  2e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 
294 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  40.35 
 
 
291 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  40.35 
 
 
291 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  40.35 
 
 
291 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
290 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
305 aa  174  2e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
294 aa  172  8e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 
294 aa  171  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 
291 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 
291 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 
291 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
275 aa  162  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  38.46 
 
 
341 aa  158  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  39.7 
 
 
637 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 
671 aa  147  2e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 
650 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  36.68 
 
 
642 aa  141  1e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 
653 aa  141  1e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  35.53 
 
 
701 aa  135  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.03 
 
 
264 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.03 
 
 
264 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  32.03 
 
 
264 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.03 
 
 
264 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.64 
 
 
264 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 
267 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.03 
 
 
264 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
264 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.25 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 
281 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.47 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.47 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  33.49 
 
 
268 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
267 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 
267 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  31.39 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
280 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
244 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23251e-09 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  9.89308e-05  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  28.36 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  29.18 
 
 
242 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  1.87582e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.64 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.75 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
242 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
242 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
266 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
242 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
242 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
242 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.09 
 
 
239 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.09 
 
 
239 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.09 
 
 
239 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.61938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.09 
 
 
239 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59131e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.09 
 
 
239 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  8.94376e-15 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.09 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 
247 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.71 
 
 
347 aa  84.7  1e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
247 aa  85.1  1e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
269 aa  84.7  1e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
246 aa  85.1  1e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  29.35 
 
 
266 aa  84.3  2e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
241 aa  84  2e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.47 
 
 
317 aa  84  2e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
250 aa  84  2e-15  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 
254 aa  84.3  2e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  29.66 
 
 
544 aa  84.7  2e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.65 
 
 
239 aa  84.7  2e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
265 aa  83.6  3e-15  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
258 aa  83.6  3e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
272 aa  83.6  3e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>