More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2285 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  100 
 
 		 141 aa  283  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  87.23 
 
 		 141 aa  250  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  47.79 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  44.12 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  45.19 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  43.07 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  41.91 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  41.48 
 
 		 165 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  41.48 
 
 		 165 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  43.22 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  42.37 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  40.74 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  41.61 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.86 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  39.13 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  38.81 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  38.19 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  40 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  38.97 
 
 		 192 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  39.26 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  40.68 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  43.22 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  38.81 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  38.81 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  40.3 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  35.56 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  40 
 
 		 165 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  38.52 
 
 		 165 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  40 
 
 		 165 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  39.71 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  41.01 
 
 		 159 aa  97.4  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  39.57 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  37.12 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  36.55 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  35.56 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  37.96 
 
 		 262 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  35.82 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  44.44 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  38.06 
 
 		 238 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  41.03 
 
 		 179 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  38.97 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  38.71 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  37.76 
 
 		 169 aa  93.6  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  36.57 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  34.59 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  31.88 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  40.68 
 
 		 166 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  34.33 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.07 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  40.17 
 
 		 179 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  40.17 
 
 		 179 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  34.03 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  36.09 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  35.56 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.56 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  37.04 
 
 		 174 aa  90.9  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  34.04 
 
 		 179 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  33.82 
 
 		 174 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  36.96 
 
 		 187 aa  90.1  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.86 
 
 		 164 aa  89.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.86 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  36.17 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  34.33 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  34.33 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  34.33 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  37.24 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  34.81 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  34.59 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  33.58 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  33.58 
 
 		 174 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  33.57 
 
 		 163 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  31.88 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  33.57 
 
 		 163 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  32.62 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  32.09 
 
 		 161 aa  88.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  34.69 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30.43 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.69 
 
 		 178 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  33.09 
 
 		 169 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  35.07 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  34.69 
 
 		 218 aa  88.6  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  39.44 
 
 		 184 aa  87.8  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  33.33 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  30.94 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  32.84 
 
 		 170 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  32.84 
 
 		 170 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  36.64 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  32.84 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 179 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  37.14 
 
 		 185 aa  87  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  33.81 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32.61 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  33.58 
 
 		 148 aa  87  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  35 
 
 		 171 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  33.1 
 
 		 185 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  38.03 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  33.1 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  31.34 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  37.59 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>