More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2253 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  54.59 
 
 		 614 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57 
 
 		 620 aa  682    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  55.91 
 
 		 633 aa  663    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  55.91 
 
 		 633 aa  662    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  55.74 
 
 		 633 aa  662    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  55.74 
 
 		 633 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  55.74 
 
 		 633 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  55.74 
 
 		 633 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.75 
 
 		 639 aa  685    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.98 
 
 		 633 aa  663    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  55.74 
 
 		 633 aa  662    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.83 
 
 		 602 aa  674    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.37 
 
 		 630 aa  658    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.7 
 
 		 676 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.34 
 
 		 646 aa  635    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  53.45 
 
 		 608 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  52.94 
 
 		 665 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.83 
 
 		 608 aa  673    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  55.74 
 
 		 633 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 599 aa  1213    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  59.43 
 
 		 645 aa  670    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.66 
 
 		 616 aa  734    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  55.81 
 
 		 633 aa  662    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.21 
 
 		 657 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.11 
 
 		 611 aa  773    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.79 
 
 		 619 aa  836    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.83 
 
 		 615 aa  711    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.52 
 
 		 635 aa  662    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.32 
 
 		 601 aa  674    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.34 
 
 		 601 aa  674    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.31 
 
 		 599 aa  660    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.6 
 
 		 621 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.15 
 
 		 639 aa  672    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.07 
 
 		 632 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.81 
 
 		 653 aa  633  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.66 
 
 		 612 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 		 612 aa  631  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  54.87 
 
 		 693 aa  631  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.71 
 
 		 643 aa  630  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.37 
 
 		 652 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.33 
 
 		 636 aa  628  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  54.23 
 
 		 700 aa  622  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.24 
 
 		 610 aa  624  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.09 
 
 		 635 aa  621  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  53.29 
 
 		 616 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.09 
 
 		 671 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.31 
 
 		 637 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.26 
 
 		 656 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.06 
 
 		 640 aa  620  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.38 
 
 		 656 aa  615  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  52.84 
 
 		 638 aa  617  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  51.08 
 
 		 681 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.04 
 
 		 630 aa  615  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.24 
 
 		 651 aa  616  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  52.1 
 
 		 637 aa  615  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  52.99 
 
 		 627 aa  615  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.27 
 
 		 637 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.39 
 
 		 638 aa  617  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.41 
 
 		 610 aa  617  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 		 640 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  53.58 
 
 		 650 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  52.32 
 
 		 649 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.92 
 
 		 640 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.74 
 
 		 697 aa  614  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.37 
 
 		 613 aa  614  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.74 
 
 		 697 aa  614  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  53.89 
 
 		 654 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  52.73 
 
 		 659 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.67 
 
 		 660 aa  611  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  53.21 
 
 		 613 aa  609  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  51.66 
 
 		 660 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.92 
 
 		 642 aa  609  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.65 
 
 		 655 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.32 
 
 		 657 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.32 
 
 		 657 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.32 
 
 		 657 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.16 
 
 		 607 aa  611  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 		 642 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.92 
 
 		 614 aa  611  1e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.92 
 
 		 642 aa  609  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.48 
 
 		 657 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.48 
 
 		 657 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  51.92 
 
 		 639 aa  608  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.26 
 
 		 657 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.75 
 
 		 651 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.09 
 
 		 640 aa  608  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.16 
 
 		 634 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  51.26 
 
 		 647 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  51.66 
 
 		 658 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  51 
 
 		 626 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.15 
 
 		 657 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  51.24 
 
 		 651 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.67 
 
 		 640 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  51.73 
 
 		 613 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.32 
 
 		 657 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.24 
 
 		 617 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.32 
 
 		 652 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.51 
 
 		 647 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.32 
 
 		 657 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  50.92 
 
 		 644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>