More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0655 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 381 aa  778    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  56.84 
 
 		 381 aa  441  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  52.24 
 
 		 380 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  48.42 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  46.56 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  46.54 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  45.5 
 
 		 382 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  46.05 
 
 		 385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  44.06 
 
 		 381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  47.49 
 
 		 379 aa  352  5e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  47.88 
 
 		 383 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  43.65 
 
 		 388 aa  346  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  45.58 
 
 		 385 aa  344  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  42.71 
 
 		 380 aa  342  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  43.8 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  45.77 
 
 		 378 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  41.64 
 
 		 380 aa  332  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  44.85 
 
 		 380 aa  328  8e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  44.68 
 
 		 381 aa  328  9e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  46.74 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  42.86 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  44.36 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  43.27 
 
 		 384 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  43.8 
 
 		 386 aa  319  6e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  43.8 
 
 		 386 aa  318  7.999999999999999e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  40.63 
 
 		 380 aa  311  9e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  43.16 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  41.62 
 
 		 398 aa  301  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  41.62 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  38.38 
 
 		 380 aa  279  6e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  38.26 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  37.5 
 
 		 379 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  37.8 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  38.44 
 
 		 390 aa  259  8e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  37.89 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  38.32 
 
 		 413 aa  250  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  36.22 
 
 		 387 aa  245  8e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  36.29 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  36.48 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  35.36 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  35.68 
 
 		 386 aa  222  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  35.54 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  33.25 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.58 
 
 		 412 aa  215  8e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.66 
 
 		 406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  34.54 
 
 		 896 aa  206  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  33.68 
 
 		 880 aa  206  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.99 
 
 		 414 aa  206  6e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.31 
 
 		 406 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  30.05 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.27 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.81 
 
 		 406 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  34.55 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  34.55 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  34.81 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  34.81 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  34.81 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  34.55 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.85 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.44 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  34.81 
 
 		 406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  34.29 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  34.29 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.33 
 
 		 885 aa  195  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  33.07 
 
 		 878 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.59 
 
 		 428 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  32.11 
 
 		 394 aa  193  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.96 
 
 		 406 aa  192  7e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.1 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  32.11 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.51 
 
 		 413 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  32.21 
 
 		 410 aa  189  5e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  31.94 
 
 		 879 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.22 
 
 		 678 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.36 
 
 		 412 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.25 
 
 		 413 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.51 
 
 		 605 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  34.03 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.51 
 
 		 414 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.7 
 
 		 657 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.99 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.93 
 
 		 662 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  31.87 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  31.19 
 
 		 688 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  29.87 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  32.65 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.21 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.77 
 
 		 420 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.46 
 
 		 413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.5 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  32.11 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  33.75 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.88 
 
 		 399 aa  182  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.57 
 
 		 408 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.23 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>