More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0139 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 251 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  80.89 
 
 		 646 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  65.59 
 
 		 650 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  63.05 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  61.38 
 
 		 250 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  57.89 
 
 		 248 aa  286  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  57.89 
 
 		 248 aa  286  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  58.92 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  56.8 
 
 		 250 aa  281  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  56.68 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  55.2 
 
 		 253 aa  281  8.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  57.2 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  58.68 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  57.43 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  53.97 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  56.22 
 
 		 257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  56.61 
 
 		 251 aa  267  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  52.78 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  55.78 
 
 		 275 aa  267  1e-70  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  55.87 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  55.74 
 
 		 252 aa  267  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  56.8 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  55.2 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  54.77 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  54.51 
 
 		 253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 251 aa  258  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 251 aa  258  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  54.96 
 
 		 251 aa  258  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  52.99 
 
 		 251 aa  258  8e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  51.43 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  52.87 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  52.87 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.16 
 
 		 655 aa  253  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  54.03 
 
 		 252 aa  252  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  52.05 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  54.8 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 250 aa  248  8e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.82 
 
 		 654 aa  245  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  52 
 
 		 256 aa  245  6e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  51.61 
 
 		 254 aa  244  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  50.8 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 249 aa  242  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  53.44 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  52.02 
 
 		 252 aa  241  7e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  48.37 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  52.63 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  54 
 
 		 253 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  54 
 
 		 253 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 257 aa  238  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 252 aa  238  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  48.83 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  52.78 
 
 		 253 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 261 aa  234  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  53.56 
 
 		 256 aa  233  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  48.62 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  50.61 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  47.97 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  48.62 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 241 aa  232  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 260 aa  231  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  50.63 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 263 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  50.63 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  50.61 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 298 aa  228  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  48.82 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>