More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0776 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 324 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  60.44 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  58.95 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  59.94 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  57.41 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  57.1 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  55.11 
 
 		 324 aa  354  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5962  KpsF/GutQ family protein  52.34 
 
 		 322 aa  339  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  51.4 
 
 		 321 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  49.84 
 
 		 321 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  48.25 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  48.4 
 
 		 323 aa  300  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  47.65 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.96 
 
 		 321 aa  298  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  48.44 
 
 		 322 aa  296  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  46.54 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  45.11 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  49.06 
 
 		 320 aa  295  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  48.12 
 
 		 322 aa  295  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 		 327 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  48.28 
 
 		 324 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  44.94 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  48.41 
 
 		 326 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  44.59 
 
 		 328 aa  291  8e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  44.75 
 
 		 326 aa  291  9e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  47.15 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  47.62 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  46.41 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  48.61 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 		 335 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  48.11 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  47.17 
 
 		 324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  50.47 
 
 		 326 aa  288  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  47.45 
 
 		 324 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  46.86 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  48.1 
 
 		 329 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  45.6 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  44.03 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.08 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  44.14 
 
 		 323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  46.86 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  48.89 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  46.33 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  45.89 
 
 		 326 aa  279  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  45.79 
 
 		 344 aa  278  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  43.96 
 
 		 331 aa  278  7e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  47.78 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  46.69 
 
 		 330 aa  278  9e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  44.83 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  45.02 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  48.1 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  44.44 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  48.89 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  43.75 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  43.75 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.93 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  44.17 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  46.03 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  43.63 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  45 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  44.69 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  45.95 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  44.1 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  47.45 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  46.2 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  46.3 
 
 		 318 aa  270  4e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  45.42 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  46.2 
 
 		 333 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.3 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  45.1 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  44.38 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  45.1 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.61 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  42.99 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.61 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  42.41 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  43.12 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  46.2 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.61 
 
 		 357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  42.35 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  44.03 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  41.69 
 
 		 321 aa  265  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  39.87 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  47.25 
 
 		 342 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  46.84 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  48.42 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  40.38 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  44.76 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  43.81 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.99 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  45.94 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  43.12 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  42.72 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  44.76 
 
 		 346 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  43.35 
 
 		 345 aa  262  6e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>