More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1098 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
272 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  78.23 
 
 
268 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  76.73 
 
 
279 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  78.76 
 
 
278 aa  427  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  77.39 
 
 
281 aa  418  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  74.81 
 
 
276 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1088  alpha/beta fold family hydrolase  69.08 
 
 
261 aa  368  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1328  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  54.05 
 
 
272 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01577  hypothetical protein  53.99 
 
 
267 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  51.55 
 
 
265 aa  295  8e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003945  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase putative  54.51 
 
 
245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0072  alpha/beta hydrolase  35.94 
 
 
257 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0171  alpha/beta hydrolase  35.94 
 
 
257 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0429  alpha/beta fold family hydrolase  34.34 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0434  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 
279 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  26.2 
 
 
261 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  26.2 
 
 
261 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  26.2 
 
 
261 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  26.2 
 
 
261 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  26.2 
 
 
261 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.2 
 
 
261 aa  89  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  23.67 
 
 
261 aa  89  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
271 aa  89  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.16 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  23.67 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  23.67 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.83 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  23.67 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  23.67 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  23.67 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  23.67 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  25.09 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  25.09 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.07 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  23.1 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.32 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.39 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  26.89 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  25.51 
 
 
256 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  24.72 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  22.73 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  24.6 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.39 
 
 
260 aa  79  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  25.86 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  23.39 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  25.83 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  25.83 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  26.25 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  25.65 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  23.28 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  24.22 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.44 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.7 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  25.77 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  23.75 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  24.31 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.98 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  23.94 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  25.68 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.67 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  24.43 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.72 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  36.89 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  26.95 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  36.89 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  26.07 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  40.43 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  23.44 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25.56 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  25.51 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  24.63 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.02 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.02 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  23.19 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>