More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0420 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  100 
 
 		 408 aa  805    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  77.59 
 
 		 407 aa  630  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  72.84 
 
 		 407 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  72.75 
 
 		 412 aa  564  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  67.16 
 
 		 421 aa  557  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  64.95 
 
 		 408 aa  511  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  62.56 
 
 		 407 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  39.75 
 
 		 418 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  37.22 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  37.44 
 
 		 426 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  35.17 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  35.65 
 
 		 429 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  34.94 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  34.16 
 
 		 451 aa  224  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  34.3 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  35.29 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  36.03 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  36.5 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 417 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 417 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  35.38 
 
 		 429 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  36.13 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  34.86 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  34.9 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  38.76 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  35.29 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  37.35 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  34.65 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  35.54 
 
 		 371 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  38.86 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  36.57 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  33.67 
 
 		 369 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  35.73 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  35.31 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 378 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  36.39 
 
 		 426 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  33.17 
 
 		 374 aa  205  9e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  36.23 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  35.34 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  37.5 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  36.05 
 
 		 368 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  34.91 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  34.14 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  38.81 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  34.81 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  34.67 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.05 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  34.96 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 371 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 373 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  31.51 
 
 		 433 aa  199  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  35.04 
 
 		 371 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  35.71 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  199  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  35.04 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  34.15 
 
 		 377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  35.2 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 368 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  32.84 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 366 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  35.02 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  36.12 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  32.11 
 
 		 378 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  36.12 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  33.67 
 
 		 363 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  36.36 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  36.12 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  36.45 
 
 		 367 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  36.12 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  36.12 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  36.34 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  36.69 
 
 		 368 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  35.31 
 
 		 398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  35.14 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  36.45 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  36.45 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  36.14 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  35.41 
 
 		 386 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  35.41 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  35.41 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  35.17 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  33.25 
 
 		 376 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  36.76 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  35.73 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  36.23 
 
 		 368 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  36.23 
 
 		 368 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  36.23 
 
 		 368 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  33.25 
 
 		 367 aa  192  7e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  35.41 
 
 		 370 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.16 
 
 		 369 aa  192  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>