289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2090 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
157 aa  321  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  68.79 
 
 
157 aa  236  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  66.88 
 
 
157 aa  227  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  55.41 
 
 
157 aa  188  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  52.87 
 
 
157 aa  179  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  52.56 
 
 
155 aa  163  1e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  43.95 
 
 
157 aa  150  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  44.94 
 
 
159 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  44.94 
 
 
159 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  41.29 
 
 
153 aa  129  1e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  40 
 
 
153 aa  126  9e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  39.1 
 
 
153 aa  126  1e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.67091e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  124  4e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 
159 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 
159 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  2.87275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  38.71 
 
 
153 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  39.74 
 
 
154 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  44.3 
 
 
159 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.53536e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  45.28 
 
 
160 aa  123  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  41.67 
 
 
153 aa  122  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  1.33759e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 
159 aa  123  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.24859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 
160 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.73176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  40.38 
 
 
153 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  43.67 
 
 
159 aa  120  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  43.67 
 
 
159 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  43.67 
 
 
159 aa  119  1e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  43.67 
 
 
159 aa  119  1e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  43.67 
 
 
159 aa  119  1e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  43.67 
 
 
159 aa  119  1e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  43.67 
 
 
159 aa  119  1e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  43.67 
 
 
159 aa  119  1e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 
159 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 
159 aa  118  4e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 
167 aa  117  5e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 
167 aa  117  5e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  37.58 
 
 
154 aa  117  5e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.55884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 
159 aa  117  8e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 
159 aa  116  1e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.42092e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  37.58 
 
 
154 aa  116  1e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  41.45 
 
 
148 aa  116  1e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34446  predicted protein  41.3 
 
 
194 aa  116  1e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693948  normal  0.0400957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  40.62 
 
 
159 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  40.13 
 
 
156 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.09351e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  40.62 
 
 
159 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.81248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 
159 aa  113  1e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  41.51 
 
 
157 aa  113  1e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  36.31 
 
 
159 aa  112  2e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
160 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  38.06 
 
 
156 aa  111  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14035e-07 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  39.74 
 
 
152 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.47821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  37.42 
 
 
155 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  39.87 
 
 
159 aa  110  7e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
160 aa  110  8e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 
177 aa  109  1e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  37.97 
 
 
159 aa  108  2e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  37.89 
 
 
159 aa  108  2e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  39.24 
 
 
158 aa  107  4e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  39.1 
 
 
152 aa  107  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  34.19 
 
 
156 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  39.51 
 
 
159 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 
160 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
159 aa  105  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
159 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
160 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  36.13 
 
 
145 aa  104  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  37.78 
 
 
145 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  1.78654e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  35.03 
 
 
155 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  37.11 
 
 
159 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 
159 aa  101  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.7339e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 
159 aa  101  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  35.26 
 
 
156 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  33.55 
 
 
155 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.27948e-07  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  31.65 
 
 
160 aa  97.1  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  7.43067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  30.57 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  34.13 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 
155 aa  95.5  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 
157 aa  95.5  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  6.37083e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 
170 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
155 aa  94.4  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
160 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  37.34 
 
 
160 aa  94.4  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 
156 aa  94  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.1317e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 
159 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0213  conserved hypothetical protein (DUF163 domain protein)  34.84 
 
 
151 aa  94  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  33.14 
 
 
174 aa  94  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  37.91 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  35.48 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  31.41 
 
 
155 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>