More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1950 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  67.16 
 
 		 206 aa  270  1e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  64.1 
 
 		 206 aa  268  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  53.57 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  50.26 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  45.13 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  40.62 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  36.22 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  38.71 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  34.24 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  30.96 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  34 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  34.87 
 
 		 217 aa  94.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  32.83 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  36.08 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  32.64 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  32.64 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 191 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  33.16 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  34.47 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  32.65 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  34.47 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  34.47 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  33.16 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08249  site-specific recombinase  33.59 
 
 		 135 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  30.93 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  30.93 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  37.25 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  32.99 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  32.12 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  30.57 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  31.09 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  30.57 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  32 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  31.76 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  34 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  32.63 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  32 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0721  resolvase domain-containing protein  29.23 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0556625 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  32 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  29.59 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  28.42 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  31.35 
 
 		 188 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  30.05 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  32.89 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  31.35 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  34.16 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  33.77 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  33.99 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  32.14 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.44 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  32.89 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  31.25 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  29.44 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  28.95 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  32.89 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  31.44 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  31.44 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  31.44 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  31.44 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  31.44 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.44 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  31.44 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  33.33 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  28.8 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  27.66 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  30.24 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  30.24 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  28.5 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  30.53 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  27.5 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  30.15 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  30.37 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  30.98 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  30.67 
 
 		 313 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  29.31 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  33.12 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  29.56 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  27.94 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  27.94 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  29.23 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  29.23 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  29.23 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  29.74 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>