More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0387 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 318 aa  653    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.18 
 
 		 319 aa  378  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  60.9 
 
 		 322 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  59.11 
 
 		 319 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  58.75 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  59.28 
 
 		 316 aa  346  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  56.07 
 
 		 319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  36.25 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.24 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  39.55 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.06 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.14 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  35.33 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  36.33 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  37.34 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.2 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.8 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  37.94 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.12 
 
 		 293 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  35.58 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  35.58 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  35.26 
 
 		 354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  35.58 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  35.96 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  37.1 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  37.1 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  37.1 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  37.1 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  37.1 
 
 		 350 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.72 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.72 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.62 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.27 
 
 		 375 aa  173  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  36.13 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  34.9 
 
 		 351 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  37.38 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  37.38 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.38 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  37.38 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  37.18 
 
 		 349 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  37.38 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  37.38 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  37.38 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  37.38 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  37.38 
 
 		 350 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 354 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  34.48 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  33.01 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  32.9 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  33.55 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  37.2 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  31.42 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  32.89 
 
 		 352 aa  165  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  36.39 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  30.82 
 
 		 353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  35.6 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  36.73 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.73 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1449  GTPase YjeQ  36.25 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.73 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  35.05 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  32.8 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.64 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  34.9 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.11 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  34.56 
 
 		 350 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.98 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.27 
 
 		 282 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  38.8 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  32.62 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  36.77 
 
 		 343 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  37.1 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  36.77 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.51 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  35.04 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  33.86 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.56 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.17 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  32.14 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  34.84 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  36.63 
 
 		 289 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  32.32 
 
 		 354 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3754  ribosome-associated GTPase  36.01 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0347  ribosome-associated GTPase  36.01 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0044619  unclonable  0.00000256254 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3932  ribosome-associated GTPase  36.01 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  33.97 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  38.33 
 
 		 340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  33.97 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  33.97 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  35.22 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.3 
 
 		 334 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  35.88 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.38 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  34.01 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  33.75 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1475  ribosome-associated GTPase  34.78 
 
 		 287 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.389799  normal  0.245969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>