133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0045 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0062  NADPH-dependent FMN reductase  74.88 
 
 		 435 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0045  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 431 aa  887    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.299294  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0759  NADPH-dependent FMN reductase  45.71 
 
 		 436 aa  408  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13637  Multimeric flavodoxin WrbA  38.5 
 
 		 191 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1044  hypothetical protein  38.4 
 
 		 170 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0780  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  30.53 
 
 		 181 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.706677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13630  Multimeric flavodoxin WrbA  35.25 
 
 		 123 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2132  hypothetical protein  37.3 
 
 		 166 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  34.81 
 
 		 250 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13635  Multimeric flavodoxin WrbA  45.12 
 
 		 87 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0994  hypothetical protein  36.78 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1065  hypothetical protein  30.89 
 
 		 162 aa  75.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.61 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  31.71 
 
 		 239 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.28 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1840  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  25.6 
 
 		 179 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1045  hypothetical protein  25.12 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.495182  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  36.04 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 		 562 aa  63.5  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2612  iron-sulfur flavoprotein  30.65 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1841  hypothetical protein  27.51 
 
 		 218 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1064  hypothetical protein  29.52 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2133  hypothetical protein  28.31 
 
 		 213 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  31.37 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  30.1 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  31.09 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  31.68 
 
 		 194 aa  57  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  30.25 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  30.91 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  32.41 
 
 		 206 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  28.43 
 
 		 193 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13650  NADPH-dependent FMN reductase  40.3 
 
 		 70 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0780061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 		 208 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 208 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 		 192 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  27.72 
 
 		 183 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  30.7 
 
 		 205 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  26.79 
 
 		 189 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0487  NADPH-dependent FMN reductase  29.52 
 
 		 199 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.671634  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  26.8 
 
 		 179 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  28.71 
 
 		 204 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 191 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  29.47 
 
 		 194 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2991  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 		 185 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 195 aa  51.6  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0301  NADPH-dependent FMN reductase  26.35 
 
 		 211 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.354287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0284  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 		 211 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  24.11 
 
 		 193 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  26.67 
 
 		 222 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 		 221 aa  50.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 213 aa  50.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  29.63 
 
 		 198 aa  50.4  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  27.27 
 
 		 178 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  27.72 
 
 		 211 aa  50.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  35.58 
 
 		 220 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  28.3 
 
 		 190 aa  50.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  25.74 
 
 		 182 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 		 184 aa  49.7  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  28.71 
 
 		 191 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  29.09 
 
 		 189 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3700  NADPH-dependent FMN reductase  32.38 
 
 		 167 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.438401  normal  0.207291 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  28.71 
 
 		 207 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  24.86 
 
 		 191 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  27.1 
 
 		 200 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  28.87 
 
 		 180 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  24.51 
 
 		 193 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  34.72 
 
 		 209 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  28 
 
 		 195 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  30.69 
 
 		 189 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  24.27 
 
 		 191 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  28.7 
 
 		 191 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  28.71 
 
 		 192 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  24.07 
 
 		 173 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  32.43 
 
 		 187 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  27 
 
 		 206 aa  47.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 		 197 aa  47.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0094  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 		 225 aa  47  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 		 220 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  29.81 
 
 		 217 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  26.21 
 
 		 195 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1956  NADPH-dependent FMN reductase  28.16 
 
 		 204 aa  46.6  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000522685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 		 217 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0869  NADPH-dependent FMN reductase  27.72 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00401648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 		 188 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 179 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 		 222 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  33.63 
 
 		 188 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  33.63 
 
 		 188 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  29 
 
 		 202 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  29.73 
 
 		 179 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  26.73 
 
 		 211 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  24.3 
 
 		 186 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  28.87 
 
 		 200 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  29.41 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  28.71 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>