269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1716 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  100 
 
 
223 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
224 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  53.12 
 
 
237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  51.98 
 
 
225 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  62.23 
 
 
269 aa  170  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  53.89 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  54.01 
 
 
239 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 
225 aa  158  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  52.41 
 
 
213 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  50.27 
 
 
291 aa  151  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  49.74 
 
 
278 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
203 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 
246 aa  148  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  48.74 
 
 
254 aa  148  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  48.92 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  50.8 
 
 
213 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
259 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
259 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
259 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  48.68 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  49.18 
 
 
221 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  50.62 
 
 
213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  47.57 
 
 
234 aa  138  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 
231 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 
260 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  46.32 
 
 
229 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  43.39 
 
 
300 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  49.73 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  44.98 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 
239 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  48.63 
 
 
217 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  41.8 
 
 
212 aa  108  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  40 
 
 
214 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  46.79 
 
 
233 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
220 aa  89  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  41.18 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  32.89 
 
 
199 aa  88.2  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  32.24 
 
 
199 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
231 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  32.74 
 
 
204 aa  85.5  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  32.52 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  34.59 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
191 aa  82  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  34.08 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  35.67 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  40.41 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
243 aa  79  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  40.97 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  40.97 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
198 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  37.16 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  36.88 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  28.86 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  36.05 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  36.05 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  38.85 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4270  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal  0.33973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  42.73 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>