263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0832 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 201 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  58.27 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  55.22 
 
 		 132 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  45.29 
 
 		 164 aa  138  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  48.37 
 
 		 151 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  47.41 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  45.26 
 
 		 130 aa  112  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  37.84 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  41.3 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  38.6 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  40.44 
 
 		 122 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  37.86 
 
 		 126 aa  99  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  40.88 
 
 		 131 aa  99  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  41.48 
 
 		 125 aa  98.6  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  41.48 
 
 		 132 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  43.17 
 
 		 131 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  41.26 
 
 		 136 aa  96.7  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  43.41 
 
 		 157 aa  95.1  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  39.02 
 
 		 152 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  36.76 
 
 		 126 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  37.2 
 
 		 151 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  41.18 
 
 		 133 aa  91.7  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  42.34 
 
 		 142 aa  90.5  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  37.76 
 
 		 130 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  39.44 
 
 		 129 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  45.26 
 
 		 131 aa  90.5  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  36.69 
 
 		 126 aa  89.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  41.86 
 
 		 154 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  39.55 
 
 		 129 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  37.5 
 
 		 123 aa  89  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  46.15 
 
 		 145 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  35.71 
 
 		 127 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  38.71 
 
 		 134 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3312  large conductance mechanosensitive channel protein  43.8 
 
 		 127 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  35.34 
 
 		 274 aa  85.1  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  46.08 
 
 		 174 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  34.91 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  38.24 
 
 		 146 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  39.1 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  34.91 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  35 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  37.78 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  41.67 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  39.86 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  39.5 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  37.88 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  41.01 
 
 		 141 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  35.92 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  36.03 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  35.92 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  38.57 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  34.55 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  38.81 
 
 		 133 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  39.57 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  38.1 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  37.67 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  42.73 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  38.81 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  35.86 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  35.17 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  34.97 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  33.56 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  40.15 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  39.29 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  35.44 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  39.39 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  36.89 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  39.26 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  33.57 
 
 		 137 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  38.52 
 
 		 127 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3277  large conductance mechanosensitive channel protein  37.06 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  36.89 
 
 		 152 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  34.78 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  37.23 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  39.85 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  39.85 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  39.85 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  39.85 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  37.68 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  37.59 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  35.57 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  36.17 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  43.8 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  36.36 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>