226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09820 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  100 
 
 		 63 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  53.23 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  57.14 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  51.72 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2516  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 56 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0416  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  52.46 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1632  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0341  ribosomal protein L30  44.26 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260811  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2047  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000587812  hitchhiker  0.00892932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1861  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1563  50S ribosomal protein L30  46.77 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.17266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1926  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1004  50S ribosomal protein L30  44.62 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0620766  decreased coverage  0.00478074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  41.94 
 
 		 63 aa  50.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0476  50S ribosomal protein L30P  44.26 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1350  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000364776  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1448  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929912  normal  0.252359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3430  50S ribosomal protein L30  41.94 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2313  50S ribosomal protein L30  43.55 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.415708 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 62 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  44 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  41.94 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1660  50S ribosomal protein L30  45.31 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0512688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0335  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.623438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1215  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1974  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0435549  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5052  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3166  50S ribosomal protein L30  41.94 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.146621  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3649  50S ribosomal protein L30  43.55 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1178  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4780  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.986627  hitchhiker  0.000000475085 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2200  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 63 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0385918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0213  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000348111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  46 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0716  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.142124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1382  50S ribosomal protein L30  41.94 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.773605  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  38.18 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  43.14 
 
 		 51 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  40.32 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1928  ribosomal protein L30  45.16 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  41.51 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 62 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>