232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2800 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  100 
 
 		 60 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  76.36 
 
 		 58 aa  87.8  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  70.69 
 
 		 61 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  65 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_004310  BR1215  50S ribosomal protein L30  63.49 
 
 		 65 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1974  50S ribosomal protein L30  63.49 
 
 		 66 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0435549  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1178  50S ribosomal protein L30  63.49 
 
 		 65 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 62 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  67.27 
 
 		 61 aa  77.8  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  61.4 
 
 		 62 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2183  50S ribosomal protein L30  61.67 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2461  50S ribosomal protein L30  61.67 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1660  50S ribosomal protein L30  60.94 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0512688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2146  50S ribosomal protein L30  61.67 
 
 		 64 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1861  50S ribosomal protein L30  62.71 
 
 		 67 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4780  ribosomal protein L30  58.33 
 
 		 60 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.986627  hitchhiker  0.000000475085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1632  ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1004  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0620766  decreased coverage  0.00478074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1926  50S ribosomal protein L30  58.33 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0335  50S ribosomal protein L30  58.33 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.623438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2200  50S ribosomal protein L30  60.34 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0385918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 62 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1350  50S ribosomal protein L30  61.82 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000364776  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1448  50S ribosomal protein L30  61.82 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929912  normal  0.252359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2313  50S ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.415708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 62 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3430  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 62 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2516  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 62 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3649  50S ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 64 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5052  50S ribosomal protein L30  60.66 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1382  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.773605  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3166  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.146621  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1563  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.17266  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0716  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.142124  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0977  50S ribosomal protein L30P  46.55 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00293682  hitchhiker  0.00137611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  42.59 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  47.62 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1928  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4225  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00829354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  46.67 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 59 aa  50.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  41.94 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0341  ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>