106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0716 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0716  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.142124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1660  50S ribosomal protein L30  68.66 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0512688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1861  50S ribosomal protein L30  65.62 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1215  50S ribosomal protein L30  65.67 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1178  50S ribosomal protein L30  65.67 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1974  50S ribosomal protein L30  65.67 
 
 		 66 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0435549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1004  50S ribosomal protein L30  65.62 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0620766  decreased coverage  0.00478074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1350  50S ribosomal protein L30  67.86 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000364776  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1448  50S ribosomal protein L30  67.86 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929912  normal  0.252359 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  61.67 
 
 		 62 aa  77.4  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  67.86 
 
 		 61 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  61.67 
 
 		 62 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  58.21 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4780  ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 60 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.986627  hitchhiker  0.000000475085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  58.33 
 
 		 62 aa  74.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  62.07 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2516  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1632  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2183  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2461  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2146  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2313  50S ribosomal protein L30  56.45 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.415708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3430  50S ribosomal protein L30  54.84 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2200  50S ribosomal protein L30  61.82 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0385918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1926  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3166  50S ribosomal protein L30  56.45 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.146621  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0335  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.623438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3649  50S ribosomal protein L30  54.84 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1382  50S ribosomal protein L30  50.79 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.773605  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 58 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5052  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1563  50S ribosomal protein L30  49.21 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.17266  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  44.64 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  44.26 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  47.17 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1244  50S ribosomal protein L30P  39.29 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186097  hitchhiker  0.00279952 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  47.92 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  52.17 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  43.5  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0977  50S ribosomal protein L30P  41.38 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00293682  hitchhiker  0.00137611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  47.83 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2047  ribosomal protein L30  48.89 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000587812  hitchhiker  0.00892932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  42  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 59 aa  42  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 62 aa  42  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  42  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  52.38 
 
 		 56 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  42.31 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  47.83 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  52.5 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 59 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 60 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 58 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  45.65 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  45.65 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 59 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  42.37 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  40.82 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  43.14 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  32.2 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>