258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2693 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  100 
 
 		 62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  54.84 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  54.84 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  54.1 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 59 aa  65.5  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 58 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  45.16 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  60 
 
 		 51 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  47.54 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2047  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000587812  hitchhiker  0.00892932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  50.88 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 56 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  44.26 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  44.07 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 56 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0412  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0387  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  43.86 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  44.83 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 61 aa  50.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1836  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.279591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0355  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  45 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  47.92 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  37.29 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1632  ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  45.9 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  45.9 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>