More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1813 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 60 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  94.92 
 
 		 59 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  94.92 
 
 		 59 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  75 
 
 		 60 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  73.21 
 
 		 60 aa  83.6  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  73.21 
 
 		 60 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  73.21 
 
 		 60 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  73.21 
 
 		 60 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  73.21 
 
 		 60 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  73.21 
 
 		 60 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  73.21 
 
 		 60 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  73.21 
 
 		 60 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  73.21 
 
 		 60 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  71.43 
 
 		 60 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  68.97 
 
 		 59 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  67.24 
 
 		 59 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  67.86 
 
 		 62 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  65.52 
 
 		 59 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  66.07 
 
 		 62 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  63.33 
 
 		 60 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 60 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  56.67 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  53.45 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 58 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  55 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 51 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  47.27 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  46.55 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0412  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0387  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  48.28 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0785  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000912341  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  46.55 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0476  50S ribosomal protein L30P  48.21 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  48.15 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1141  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.529136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>