255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2601 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 58 aa  116  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  70.69 
 
 		 60 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 61 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  54.55 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 61 aa  60.1  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  55.36 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 58 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  58 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  58 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1632  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2516  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2183  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2146  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2461  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1004  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0620766  decreased coverage  0.00478074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1861  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  51.72 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4780  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.986627  hitchhiker  0.000000475085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 61 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2200  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0385918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  44.64 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 57 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  46.55 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  50.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1660  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0512688  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>