258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1165 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  100 
 
 		 60 aa  118  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  70.69 
 
 		 59 aa  90.5  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 60 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 58 aa  80.5  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  64.91 
 
 		 61 aa  77  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  55.17 
 
 		 58 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  61.82 
 
 		 57 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  61.82 
 
 		 57 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  56.67 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  58.62 
 
 		 58 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  60 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0444  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000247564  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0977  50S ribosomal protein L30P  52.54 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00293682  hitchhiker  0.00137611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  50 
 
 		 51 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  52.54 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>