252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0620 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  73.68 
 
 		 61 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  62.71 
 
 		 59 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  62.5 
 
 		 58 aa  65.5  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  55.36 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  47.37 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  52.54 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  48.21 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1928  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 51 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  43.75 
 
 		 57 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2354  ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230884  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  37.29 
 
 		 62 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2047  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000587812  hitchhiker  0.00892932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  40.68 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  37.04 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  37.04 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  37.04 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  37.04 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  37.04 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  37.29 
 
 		 60 aa  48.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>