More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0233 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  70.69 
 
 		 59 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  72.41 
 
 		 59 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  72.41 
 
 		 59 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  68.97 
 
 		 60 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  69.64 
 
 		 62 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  67.86 
 
 		 62 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  66.1 
 
 		 59 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  66.67 
 
 		 51 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  61.4 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  61.4 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  61.4 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  61.02 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  57.89 
 
 		 60 aa  70.1  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  63.79 
 
 		 59 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 62 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  60.34 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  63.64 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  53.85 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  60.34 
 
 		 61 aa  63.5  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0451  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  56.9 
 
 		 58 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  53.45 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0785  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000912341  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0412  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0387  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 62 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  60.38 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0345  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0515  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181031  unclonable  0.0000000000137591 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  56.9 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  60.1  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  60.1  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  52.83 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>