294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4932 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  100 
 
 		 62 aa  126  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  66.07 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  62.3 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  62 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 63 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 62 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  52.63 
 
 		 60 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  51.79 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 61 aa  63.5  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 58 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 58 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  54.55 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  52.73 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  44.64 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  57.78 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  48.21 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  48.15 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 62 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  59.57 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 51 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  48.21 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>