287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0493 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 60 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  96.67 
 
 		 60 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  86.67 
 
 		 60 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  84.75 
 
 		 61 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  81.67 
 
 		 60 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  80 
 
 		 60 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  81.67 
 
 		 60 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  78.33 
 
 		 60 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 63 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  81.36 
 
 		 62 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  85.96 
 
 		 60 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  87.04 
 
 		 60 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  88.89 
 
 		 60 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  84.21 
 
 		 60 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  84.21 
 
 		 60 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  81.36 
 
 		 62 aa  96.7  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  82.46 
 
 		 60 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  82.46 
 
 		 60 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  87.04 
 
 		 60 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  78.33 
 
 		 60 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4225  ribosomal protein L30  73.33 
 
 		 60 aa  94.4  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00829354  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  75 
 
 		 60 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  71.43 
 
 		 60 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  71.43 
 
 		 60 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0785  ribosomal protein L30  73.58 
 
 		 62 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000912341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  61.11 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  60 
 
 		 61 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  64.15 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 59 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  60 
 
 		 58 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 58 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 58 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  56.36 
 
 		 58 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 62 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  60.38 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  60.38 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0341  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 63 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260811  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  60.38 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04502  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  58.49 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06430  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0855  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.342105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0774  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.797874  normal  0.0109513 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0355  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1836  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.279591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09030  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0258453  normal  0.264293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  60.87 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 59 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0977  50S ribosomal protein L30P  52.83 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00293682  hitchhiker  0.00137611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 59 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0451  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  50.94 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>