283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0726 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  100 
 
 		 57 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  53.85 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  52.94 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  56 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  48 
 
 		 51 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  54 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  54 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  56 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  54 
 
 		 58 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  49.02 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  52 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  47.06 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  46.94 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1084  50S ribosomal protein L30  52.94 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  45.1 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  48.08 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  46.94 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  54.17 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  46.15 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0412  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0387  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  46.15 
 
 		 57 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  46.15 
 
 		 57 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  46.94 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  55.1 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  48 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  46.15 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  48 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  51.02 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  48 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  51.06 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  48.08 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>