279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4361 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  70.18 
 
 		 61 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  69.49 
 
 		 59 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  62.71 
 
 		 59 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  62.71 
 
 		 60 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  73.9  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  62.5 
 
 		 63 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  60.34 
 
 		 59 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  59.32 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 61 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  53.45 
 
 		 58 aa  60.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  50 
 
 		 58 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 61 aa  60.1  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 58 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 58 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  50.85 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  54.55 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0213  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000348111  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  48 
 
 		 51 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  45.76 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  45.76 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  49.09 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>