More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS0128 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
60 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
60 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
60 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
60 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
60 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
60 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
60 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
60 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  98.33 
 
 
60 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  98.33 
 
 
60 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  98.33 
 
 
60 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  74.58 
 
 
62 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 
62 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  76.79 
 
 
59 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  76.79 
 
 
59 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  73.21 
 
 
60 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  67.27 
 
 
59 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  64.91 
 
 
59 aa  73.6  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  64.91 
 
 
59 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 
59 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  52.54 
 
 
60 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  62.5 
 
 
60 aa  71.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  56.14 
 
 
58 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  61.4 
 
 
61 aa  70.5  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 
75 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  64.29 
 
 
60 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  56.14 
 
 
59 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 
61 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  59.65 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  58.93 
 
 
60 aa  68.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  57.63 
 
 
60 aa  67.4  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  55.93 
 
 
62 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 
61 aa  66.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0785  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
61 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00447996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  58.18 
 
 
60 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  55.36 
 
 
59 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  53.57 
 
 
60 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  53.57 
 
 
60 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 
59 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
59 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 
57 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 
57 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 
59 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  54.24 
 
 
59 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 
60 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 
58 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 
59 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 
59 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 
59 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  54.24 
 
 
59 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 
59 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 
60 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 
59 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  59.26 
 
 
61 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  54.24 
 
 
62 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 
60 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 
59 aa  62.8  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 
59 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 
59 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 
60 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  51.79 
 
 
60 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  57.41 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  57.14 
 
 
59 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 
60 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  57.41 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 
60 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  59.62 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 
60 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 
59 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 
59 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 
59 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 
59 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 
59 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  51.79 
 
 
60 aa  60.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  53.33 
 
 
61 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
62 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 
61 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 
62 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 
60 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 
60 aa  60.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  49.15 
 
 
61 aa  60.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 
59 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 
60 aa  60.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 
60 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  52 
 
 
51 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  50.88 
 
 
60 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 
59 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
59 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0785  ribosomal protein L30  50.94 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000912341  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
59 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
59 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  53.57 
 
 
60 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
59 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.935152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>