221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1465 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 60 aa  121  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  75.44 
 
 		 60 aa  92  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  69.49 
 
 		 61 aa  88.2  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0213  50S ribosomal protein L30  65 
 
 		 60 aa  81.6  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000348111  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 60 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 59 aa  74.3  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  60.34 
 
 		 59 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  60.34 
 
 		 59 aa  71.2  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  56.67 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 59 aa  67  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  45 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  50.85 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  50.94 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 63 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  54.72 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  55.1 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  56.25 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 75 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 62 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  40 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  40.68 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  44.83 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0412  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0387  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1141  ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.529136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0472  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291193  hitchhiker  0.00000269713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0505  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00113735  normal  0.0573997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0416  ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 63 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0502  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000122641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  43.33 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>