289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1633 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  100 
 
 		 61 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  73.68 
 
 		 59 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  70.18 
 
 		 59 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  64.91 
 
 		 60 aa  77  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 60 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 59 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  61.82 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  70.37 
 
 		 58 aa  69.7  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 58 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 58 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  57.89 
 
 		 58 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  53.45 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  61.11 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  57.89 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  55 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  59.26 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  59.26 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  59.26 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  59.26 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  59.26 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  59.26 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  59.26 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  59.26 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  61.4 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  52.63 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0444  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000247564  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2354  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0977  50S ribosomal protein L30P  47.54 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00293682  hitchhiker  0.00137611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1928  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2151  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0556857  normal  0.316331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  55.1 
 
 		 51 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  56.14 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06430  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340792  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  53.45 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  45.9 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>