More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0860 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  100 
 
 		 66 aa  130  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  64.41 
 
 		 62 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  62.71 
 
 		 62 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  65.52 
 
 		 61 aa  73.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 60 aa  73.2  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  62.71 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 61 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  62.5 
 
 		 59 aa  70.9  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  61.82 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  60.34 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 61 aa  70.1  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 62 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  63.16 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  58.73 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 60 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  56.45 
 
 		 63 aa  67  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  56.9 
 
 		 60 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  60.34 
 
 		 60 aa  67  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  55.17 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  63.46 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  56.14 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  55.56 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  50.88 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  50.82 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  51.72 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 57 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 57 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  51.72 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>