259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1167 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 78 aa  158  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  77.78 
 
 		 75 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  66.07 
 
 		 62 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 60 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  60.71 
 
 		 60 aa  77.4  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 61 aa  76.6  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 60 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 61 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  62.75 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  62.75 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 62 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  60 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  51.72 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  50.91 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  52.73 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0785  50S ribosomal protein L30  54 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00447996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  51.85 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  53.06 
 
 		 51 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>