197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0179 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 60 aa  122  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  62.71 
 
 		 59 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  62.07 
 
 		 61 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3144  50S ribosomal protein L30P  57.41 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00426449  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  45.76 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  45.61 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  47.46 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  44.07 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  50.4  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  50.1  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  42.11 
 
 		 58 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  42.37 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  40.68 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  42.37 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  42.11 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1244  50S ribosomal protein L30P  43.4 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186097  hitchhiker  0.00279952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2461  50S ribosomal protein L30  45.1 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2146  50S ribosomal protein L30  45.1 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2183  50S ribosomal protein L30  45.1 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  38.18 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  44.23 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  35.09 
 
 		 62 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 59 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 62 aa  47.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0346  ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0149627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 59 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>