251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2211 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 61 aa  123  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  85.25 
 
 		 62 aa  111  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  85 
 
 		 61 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  78.69 
 
 		 66 aa  103  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  83.33 
 
 		 61 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  78.69 
 
 		 61 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  79.66 
 
 		 63 aa  98.6  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0346  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0149627  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  53.97 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  52.38 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  54.1 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  45.76 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  50 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  45.9 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 		 59 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 60 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  43.86 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>