260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3399 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  84.75 
 
 		 60 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  72.88 
 
 		 61 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  74.58 
 
 		 60 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  71.19 
 
 		 61 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  69.49 
 
 		 59 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  67.8 
 
 		 60 aa  80.1  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  67.8 
 
 		 60 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  64.41 
 
 		 60 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  68.42 
 
 		 65 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  67.8 
 
 		 62 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  66.1 
 
 		 60 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  66.1 
 
 		 60 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  62.71 
 
 		 60 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 60 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  61.02 
 
 		 60 aa  74.7  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1062  50S ribosomal protein L30  72.92 
 
 		 59 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000861748  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 65 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  57.63 
 
 		 60 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1033  50S ribosomal protein L30  70.83 
 
 		 61 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000415927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1050  50S ribosomal protein L30  70.83 
 
 		 61 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0317363  normal  0.122599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 61 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  54.24 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  50.85 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1104  ribosomal protein L30p/L7e  67.8 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  56.14 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2670  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2958  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  47.46 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1141  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.529136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16990  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000049489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  57  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0476  50S ribosomal protein L30P  47.37 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 62 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  42.37 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2151  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0556857  normal  0.316331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  44.83 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  45.61 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  50.8  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  46.3 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>