164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2670 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2670  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 68 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2958  50S ribosomal protein L30  86.76 
 
 		 68 aa  120  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16990  50S ribosomal protein L30  76.56 
 
 		 74 aa  100  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000049489  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  61.4 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  59.32 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  61.4 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 60 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  59.65 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  59.65 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  54.39 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  49.15 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  51.79 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1062  50S ribosomal protein L30  52.08 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000861748  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1141  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.529136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1033  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000415927  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  48.28 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1050  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0317363  normal  0.122599 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1104  ribosomal protein L30p/L7e  57.89 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 61 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  47.54 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 62 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  49.09 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  42.11 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  41.38 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  41.27 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  45.45 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0283  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147317  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0346  ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0149627  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>