265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1725 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  74.58 
 
 		 60 aa  85.5  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 62 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  59.65 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  54.1 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  54.1 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  54.1 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  55 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  54.24 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  50.82 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 59 aa  62  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  50.82 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  54.1 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 		 59 aa  60.1  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  54.1 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0412  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0387  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  50.82 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  55 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  48.15 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  50.82 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0213  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000348111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  50.82 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  49.18 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>