149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_16990 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_16990  50S ribosomal protein L30  100 
 
 
74 aa  150  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000049489  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2670  50S ribosomal protein L30  76.56 
 
 
68 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2958  50S ribosomal protein L30  73.44 
 
 
68 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  59.32 
 
 
60 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  62.71 
 
 
60 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  59.32 
 
 
60 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  54.24 
 
 
60 aa  62.8  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  56.14 
 
 
60 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 
60 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  53.45 
 
 
60 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  50.85 
 
 
60 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  52.54 
 
 
60 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  54.24 
 
 
60 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 
60 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  54.24 
 
 
60 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  51.72 
 
 
59 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 
61 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 
59 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1358  ribosomal protein L30  50.88 
 
 
61 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  49.15 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  50 
 
 
61 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0346  ribosomal protein L30  47.17 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0149627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  50.91 
 
 
59 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  46.55 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  41.67 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 
59 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  48.21 
 
 
59 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  48.21 
 
 
59 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  50 
 
 
59 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 
59 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 
59 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 
61 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 
59 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 
59 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 
59 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 
59 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  41.38 
 
 
59 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 
59 aa  50.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 
59 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 
59 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1104  ribosomal protein L30p/L7e  57.63 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 
63 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  39.34 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  47.37 
 
 
60 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 
60 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 
58 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 
58 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 
60 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  42.11 
 
 
58 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  38.33 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  40.68 
 
 
60 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3977  ribosomal protein L30  40.74 
 
 
59 aa  47.4  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1062  50S ribosomal protein L30  45.83 
 
 
59 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000861748  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  44.44 
 
 
60 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 
60 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  40.68 
 
 
60 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  48.28 
 
 
61 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  37.29 
 
 
61 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  43.86 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  45 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1267  ribosomal protein L30  44.44 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 
59 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1033  50S ribosomal protein L30  43.75 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000415927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  38.98 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1050  50S ribosomal protein L30  43.75 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0317363  normal  0.122599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  36.84 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  42.86 
 
 
60 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  45.28 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>