281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2137 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  100 
 
 		 61 aa  118  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  60.66 
 
 		 61 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  65.52 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  58.33 
 
 		 60 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  60 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  57.38 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  55.74 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  56.67 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  55 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  58.93 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  55.74 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  56.67 
 
 		 60 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  56.67 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  58.33 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  50.82 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  53.45 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 58 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 58 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0476  50S ribosomal protein L30P  59.65 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  55 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  53.45 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0416  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  56.36 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  51.67 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  47.46 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 58 aa  60.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  57.41 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0451  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2151  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0556857  normal  0.316331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2354  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0345  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0515  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181031  unclonable  0.0000000000137591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  52.73 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4225  ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00829354  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>