196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2047 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2047  ribosomal protein L30  100 
 
 		 60 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000587812  hitchhiker  0.00892932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  65.45 
 
 		 56 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 56 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 56 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 56 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  52.94 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  50.91 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0273  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0832356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0678  ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0416  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  47.17 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  41.07 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  37.5 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  37.74 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 59 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 62 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  39.62 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  45.83 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0355  50S ribosomal protein L30  35.71 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  45.1 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1836  50S ribosomal protein L30  35.71 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.279591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4225  ribosomal protein L30  37.74 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00829354  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  37.74 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  37.74 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  48 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>