238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1573 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 60 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  56.86 
 
 		 57 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0785  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00447996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 62 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 62 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  45.61 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 62 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  44.64 
 
 		 58 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>