225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2889 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  100 
 
 		 60 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  70.69 
 
 		 58 aa  89  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  58.93 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  56.67 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  50.91 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 62 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1004  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0620766  decreased coverage  0.00478074 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1861  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1632  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  50 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 56 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  50 
 
 		 64 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2516  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0273  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0832356  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  42.86 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1660  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0512688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4780  ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.986627  hitchhiker  0.000000475085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1350  50S ribosomal protein L30  54 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000364776  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1448  50S ribosomal protein L30  54 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929912  normal  0.252359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1974  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0435549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1215  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  52 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1178  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.109689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0335  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.623438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 56 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  44.83 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0416  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2461  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0716  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.142124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2146  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2183  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319169 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2200  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0385918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1926  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5052  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 61 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  40.68 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>