162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0273 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0273  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 59 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0832356  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0283  50S ribosomal protein L30  64.41 
 
 		 59 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147317  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2047  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000587812  hitchhiker  0.00892932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 62 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  39.66 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  36.21 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  35.71 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2151  ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0556857  normal  0.316331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0785  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00447996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  37.5 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  42.11 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 56 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6596  ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04502  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  37.5 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0774  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.797874  normal  0.0109513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  31.58 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29560  LSU ribosomal protein L30P  43.1 
 
 		 60 aa  47.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.349049  normal  0.73381 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  32.76 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 60 aa  47.4  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2670  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  37.5 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  38.18 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3931  50S ribosomal protein L30  37.74 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  40.68 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  36.36 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2036  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  47.83 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1928  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  36.21 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  39.66 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1951  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  37.93 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1929  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.630046 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  41.82 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  37.93 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3688  ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00000284143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0269  ribosomal protein L30  37.93 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32791  predicted protein  41.82 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  45.45 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2958  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>