178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2756 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  100 
 
 		 56 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 56 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2047  ribosomal protein L30  53.7 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000587812  hitchhiker  0.00892932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 56 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  48.21 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  56.6 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2693  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 62 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 62 aa  52  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1244  50S ribosomal protein L30P  48.21 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186097  hitchhiker  0.00279952 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 58 aa  51.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 58 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  47.17 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 62 aa  50.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  52.94 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0678  ribosomal protein L30  40 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  52.94 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1632  ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0243  ribosomal protein L30  48.98 
 
 		 51 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  46.81 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  47.27 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1004  50S ribosomal protein L30  48.94 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0620766  decreased coverage  0.00478074 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1861  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1376  50S ribosomal protein L30  56 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0327114  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  40 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0716  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.142124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1310  50S ribosomal protein L30  56 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988415  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0774  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.797874  normal  0.0109513 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  50.98 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1143  ribosomal protein L30  60.53 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000025708  normal  0.0109898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1448  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929912  normal  0.252359 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  38.18 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0338  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00211446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1350  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000364776  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  38.18 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2516  50S ribosomal protein L30  38.18 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  44 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04502  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>