240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1928 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1928  ribosomal protein L30  100 
 
 		 64 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  59.02 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0355  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1836  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.279591  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1861  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2146  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2461  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2183  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2200  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0385918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0335  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.623438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1004  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0620766  decreased coverage  0.00478074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1632  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.108168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3649  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0313  ribosomal protein L30  50 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00845621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1448  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.929912  normal  0.252359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1350  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000364776  normal  0.271077 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  47.62 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1926  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  50.91 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 60 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2313  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.415708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3430  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0476  50S ribosomal protein L30P  48.28 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2354  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1382  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.773605  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  45.61 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5052  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1084  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5769  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_004310  BR1215  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1178  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1974  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0435549  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1563  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.17266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0423  50S ribosomal protein L30  47.54 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.60192  normal  0.209018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3166  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.146621  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2151  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0556857  normal  0.316331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1854  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293494  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1660  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0512688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4780  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.986627  hitchhiker  0.000000475085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  45.61 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0341  ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4932  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0130019  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>