More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1876 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 381 aa  780    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  56.84 
 
 		 381 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  50.13 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  49.21 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  47.34 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0304  selenocysteine lyase  45.65 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000158193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  45.26 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1219  cysteine desulfurase family protein  46.17 
 
 		 384 aa  353  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  44.68 
 
 		 380 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  44.21 
 
 		 385 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  44.03 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  44.44 
 
 		 388 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  47.75 
 
 		 378 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  48.76 
 
 		 383 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  45.5 
 
 		 379 aa  332  9e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  43.65 
 
 		 383 aa  330  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  43.35 
 
 		 381 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  42.29 
 
 		 380 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  43.77 
 
 		 385 aa  325  9e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2316  cysteine desulfurase family protein  44.47 
 
 		 383 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  41.91 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  43.8 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  42.52 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  42.63 
 
 		 385 aa  309  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  41.95 
 
 		 380 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  41.11 
 
 		 381 aa  296  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  39.89 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  39.89 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  37.7 
 
 		 398 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  39.05 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0679  aminotransferase, class V  39.27 
 
 		 382 aa  275  9e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0028  aminotransferase class V  39.11 
 
 		 380 aa  272  8.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.354528  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  36.73 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0250  cysteine desulfurase family protein  38.44 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  37.23 
 
 		 379 aa  258  8e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  37.27 
 
 		 388 aa  253  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0365  Cysteine desulfurase  36.91 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.60313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  37.33 
 
 		 413 aa  249  8e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2460  aminotransferase, class V  37.37 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0711666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3910  Cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  35.16 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.75 
 
 		 885 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0255  aminotransferase, class V  35.17 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.409  normal  0.112068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  35.34 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0298  aminotransferase, class V  32.81 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  33.94 
 
 		 896 aa  210  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  34.65 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  34.04 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  34.55 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  32.29 
 
 		 878 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  32.73 
 
 		 880 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_002950  PG1751  aminotransferase, class V  30.16 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  31.5 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.34 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.04 
 
 		 413 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.14 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.69 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.21 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.04 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.54 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.69 
 
 		 406 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  31.75 
 
 		 879 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.71 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  31.85 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  30.83 
 
 		 404 aa  179  9e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.69 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.3 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  29.56 
 
 		 408 aa  177  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.43 
 
 		 420 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.85 
 
 		 414 aa  176  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  29.13 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  30.55 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  30.59 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  29.69 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  30.49 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.79 
 
 		 414 aa  173  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.63 
 
 		 415 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  33.08 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.69 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.68 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  31.87 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  29.61 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.38 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.94 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  31.95 
 
 		 420 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.46 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  28.43 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  29.72 
 
 		 423 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.59 
 
 		 418 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.17 
 
 		 419 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.59 
 
 		 418 aa  169  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.57 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.35 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.27 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.5 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.1 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  29.58 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  30.93 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.57 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  30.65 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>