More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0085 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  54.91 
 
 
693 aa  635    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.49 
 
 
630 aa  647    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.34 
 
 
602 aa  666    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
619 aa  1254    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.08 
 
 
620 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  56.03 
 
 
645 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.09 
 
 
616 aa  701    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.69 
 
 
611 aa  751    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.79 
 
 
599 aa  815    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.67 
 
 
608 aa  658    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.86 
 
 
632 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.63 
 
 
601 aa  673    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.47 
 
 
601 aa  672    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.09 
 
 
657 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 
599 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.22 
 
 
615 aa  697    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.98 
 
 
639 aa  671    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.69 
 
 
635 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.18 
 
 
639 aa  634  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.24 
 
 
676 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.47 
 
 
614 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  52.78 
 
 
633 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  52.4 
 
 
608 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  52.94 
 
 
633 aa  628  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.64 
 
 
621 aa  628  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.92 
 
 
653 aa  627  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  52.61 
 
 
633 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  52.61 
 
 
633 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  52.61 
 
 
633 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  52.61 
 
 
633 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  52.61 
 
 
633 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  52.61 
 
 
633 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.86 
 
 
633 aa  625  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  52.61 
 
 
633 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.28 
 
 
637 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  52.37 
 
 
665 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.9 
 
 
643 aa  622  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.57 
 
 
655 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.03 
 
 
636 aa  617  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  52.26 
 
 
616 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  52.31 
 
 
659 aa  617  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.81 
 
 
657 aa  617  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.91 
 
 
612 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.81 
 
 
652 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.07 
 
 
612 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.83 
 
 
671 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.71 
 
 
640 aa  609  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.91 
 
 
646 aa  608  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  52.72 
 
 
650 aa  611  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.86 
 
 
607 aa  611  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  51.47 
 
 
700 aa  605  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.24 
 
 
638 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  52.32 
 
 
643 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.65 
 
 
656 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.96 
 
 
638 aa  608  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.97 
 
 
635 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  51.54 
 
 
627 aa  605  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.91 
 
 
657 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  51.58 
 
 
649 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.99 
 
 
657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.92 
 
 
637 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.24 
 
 
657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 
647 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 
647 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.5 
 
 
609 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000237353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.99 
 
 
657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.99 
 
 
652 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.62 
 
 
697 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.91 
 
 
657 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.67 
 
 
657 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  50.25 
 
 
639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 
647 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.07 
 
 
657 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 
647 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.62 
 
 
697 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.99 
 
 
657 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.07 
 
 
654 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.33 
 
 
656 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  51.99 
 
 
644 aa  601  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.99 
 
 
647 aa  601  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.92 
 
 
608 aa  600  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.81 
 
 
651 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 
650 aa  601  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.92 
 
 
672 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.13 
 
 
635 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 
644 aa  601  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  51.82 
 
 
649 aa  601  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 
647 aa  601  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.93 
 
 
634 aa  600  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  51.82 
 
 
647 aa  599  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  51.99 
 
 
644 aa  601  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  51.82 
 
 
647 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  51.82 
 
 
647 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 
647 aa  601  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.96 
 
 
647 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  51.99 
 
 
644 aa  601  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  51.32 
 
 
644 aa  596  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.57 
 
 
650 aa  595  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.04 
 
 
634 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.03 
 
 
637 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>