More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3302 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
231 aa  464  1e-130  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  66.38 
 
 
231 aa  314  9e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 
229 aa  244  1e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 
229 aa  239  3e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.25 
 
 
243 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  52.86 
 
 
297 aa  238  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 
230 aa  234  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 
232 aa  231  8e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  54.71 
 
 
230 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  4.63151e-06 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 
237 aa  230  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 
246 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 
263 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 
263 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 
263 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  51.95 
 
 
233 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  53.68 
 
 
248 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 
251 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 
232 aa  224  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  52.63 
 
 
251 aa  224  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 
251 aa  224  9e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 
240 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 
265 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 
265 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 
237 aa  222  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 
235 aa  222  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  50 
 
 
246 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  50 
 
 
246 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  51.56 
 
 
244 aa  222  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  51.56 
 
 
244 aa  222  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 
251 aa  221  5e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 
231 aa  221  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52 
 
 
239 aa  221  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3085  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.3 
 
 
232 aa  219  4e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.15463e-09  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.5 
 
 
235 aa  218  4e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 
230 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 
231 aa  218  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  4.30064e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 
227 aa  218  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.11 
 
 
222 aa  217  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  47.86 
 
 
239 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.11905e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 
231 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 
228 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 
238 aa  215  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 
236 aa  215  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
231 aa  214  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  50.22 
 
 
232 aa  214  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 
234 aa  214  1e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 
251 aa  214  1e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 
237 aa  213  2e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  47.79 
 
 
236 aa  213  2e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 
223 aa  213  2e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.64 
 
 
234 aa  212  3e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  47.11 
 
 
223 aa  213  3e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 
226 aa  212  3e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.76926e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 
228 aa  211  8e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.28008e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.35 
 
 
240 aa  210  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 
233 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
236 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 
236 aa  210  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 
230 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  4.66515e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.36 
 
 
239 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 
237 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.15937e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 
228 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.92e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
229 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  47.86 
 
 
230 aa  209  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 
236 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 
236 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  1.82155e-08 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
321 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
234 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 
257 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  47.58 
 
 
234 aa  208  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
234 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 
234 aa  208  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
245 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 
230 aa  208  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  54.46 
 
 
229 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 
233 aa  207  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 
250 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 
230 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.77207e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 
238 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 
238 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 
227 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  46.96 
 
 
241 aa  206  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
229 aa  205  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 
234 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
226 aa  205  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 
237 aa  205  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  47.19 
 
 
239 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  47.19 
 
 
239 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.73192e-15 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  47.19 
 
 
239 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.19 
 
 
239 aa  204  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  47.19 
 
 
239 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.19 
 
 
239 aa  204  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 
229 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  48.25 
 
 
227 aa  204  8e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  47.19 
 
 
239 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 
236 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 
234 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 
236 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 
239 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 
227 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.51147e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>